医药用纯化水设备制取纯化水是一个连续、稳定地将原水“净化”的过程。反渗透膜作为纯化水设备的关键部件，主要用途是将水中的杂质去除，可以预见它在系统长期运行的过程中会出现堵塞的情况，同时这也是造成医药用纯化水设备堵塞的重要原因。
造成
医药用纯化水设备堵塞的原因主要分为三类：
1、悬浮物、胶体污堵。在工艺设计时，纯化水系统实现质量控制的两大核心在于控制颗粒物和控制微生物。由于水中含有各种各样的悬浮物、溶解物质和胶体物质。在RO膜发挥分离水和溶质进行的作用过程，这些杂质会附着在RO膜表面造成RO膜堵塞，进而导致设备出现堵塞。从这一角度来看，根据原水水质来选择合适的预处理系统具有必要性和重要性。比如，将多介质过滤器、双软化器、活性炭过滤器等装置进行组合而形成预处理系统，对原水进行适当处理，使得出水水质符合后续RO膜的进水要求，可以降低RO系统过滤的压力，同时也有利于延长RO膜的使用寿命。
2、化学结构。原水经过RO系统处理后，假设按RO系统75%的回收率计算，那么浓水已经过4倍的浓缩，此时水质的离子浓度远超于其饱和度，结晶析出后形成水垢，会造成医药用纯化水设备堵塞。
3、生物污堵。由于地表水含有大量的微生物，当以天然水作为水源来制备纯化水时，会有大量的微生物进入RO系统，并且医用纯化水系统的使用环境极易滋生微生物，随着微生物的生长就会在系统内形成难以去除的生物膜，这就是常见的生物污堵问题。因此，在纯化水制备时，需要对原水进行预处理，定期清洗设备，对设备进行杀菌消毒处理，从而控制系统的微生物污染水平。
